Kentin çeşitli yerlerinden – MÖ 7000 yıllık Yumuktepe, Gözlükule, Soli, Elaiusse Sebaste, Kanytelis vb. – çeşitli dönemlere -bakır, tunç, demir çağları,Helen, Roma, Bizans dönemleri, Selçuklu, Karamanoğulları, Ramazanoğulları, Osmanlı- ait eserleri sergilemek için 1978 yılında açılan müze, 2017 yılında Yenişehir- Muğdat Cami yanına, Deniz Müzesi yanındaki modern binasına taşınmıştır. İlde yer alan 4 arkeoloji müzesinin -Tarsus, Silifke, Anamur- en büyüğü Arkeoloji Müzesi içinde etnografik eserler de sergilenmektedir.
Bahçesiyle beraber yaklaşık 70 bin m2’lik alana yayılan iki katlı müzenin alt katında cilalı taş dönemi konutu (diorama), antik zeytinyağı atölyesi, amfora havuzu,Yumuktepe hu adlı kulübe ile üst katında çoğunluğu vitrinlerde 6095 arkeolojik eserin 1435’i adeti, 890 adet etnografik eser ve 24904 adet sikke, sikke, 440 mühür sergilenmektedir. Ayrıca binada 32464 eserlik bir kütüphane, çocuk oyun odası, satış reyonu da bulunmaktadır.